EMOT’un kuruluş öyküsü, 1986 yılında Prof. Dr. Arslan Bora ve Prof. Dr. Sait Ada’nın İzmir’de ortak muayenehane açmasıyla başladı. O dönemde, eş zamanlı olarak SSK İzmir –Buca Eğitim Hastanesi’nde başasistanlık yapmakta olan iki profesör, birlikte el cerrahisi ve mikrocerrahi merkezi oluşturma projesini hayata geçirmek üzere yola çıktılar. Bu oluşum için ABD'deki görevinden ayrılan Uzm. Fzt. Firdevs Kul ve Op. Dr. Fuat Özerkan da bu projeye dahil oldu.

1986 yılında, İzmir’de ilk replantasyon, Prof. Dr. Arslan Bora tarafından SSK İzmir-Buca Eğitim hastanesinde yapıldı. El Cerrahisi grubu adı altında gerek Buca Eğitim, gerekse özel hastanelerde pek çok el cerrahisi -mikrocerrahi girişim ve rehabilitasyon gerçekleştirildi. Bu gelişmeler ışığında, geleceğe yönelik planların tamamlanması ve alt yapı sorunlarının çözümlenmesi ile Prof. Dr. Arslan Bora önderliğinde hastaneye dönüşme kararı verildi. Kurucuların çoğunluğu, hastanenin aynı zamanda çalışanları ile maddi beklentisi olmadan kuruluşa destek veren hocalar ve dostlar oldu. Bu girişimler ve desteklerle EMOT,  1991 yılında İzmir’in ilk özel dal hastanesi ve Türkiye’deki ilk El ve Mikrocerrahi Özel Dal Hastanesi olarak sağlıklı bir yaşam için kapılarını açtı. 1993 yılında Doç. Dr. İbrahim Kaplan ve Doç. Dr. Yalçın Ademoğlu ekibe katılarak hastanenin gücünü arttırdı.

1999 yılında ameliyathane ve yatak sayısı arttırıldı, hekim kadrosu güçlendirildi ve böylece fiziksel olarak da büyüyen EMOT, bölgenin önde gelen acil Mikrocerrahi ve Travmatoloji merkezine dönüştü. Ellektif olgular ile yılda ortalama 3.000 ameliyat ve 10.000 poliklinik sayısına ulaştı, bölgede ve ülkede en güvenilir kuruluş olma yolunda hızla ilerledi.

Bilimsel araştırmalar ile sürekli meslek içi eğitim ve etik ilkeler EMOT’un felsefesini oluşturmaktadır. İlk günden bu yana, felsefesinden taviz vermeden büyümeyi sürdüren EMOT, aynı zamanda daha sağlıklı bir toplum için geleceğin uzmanlarını yetiştirmek amacıyla, genç meslektaşlarına üst düzeyde Ortopedi Travmatoloji ve El Cerrahisi-Mikrocerrahi eğitimi vermektedir.